吴宗宪的争议新闻不少。 艺人吴宗宪不满《苹果日报》两度指他和女歌迷Linda发生性关系，因此控告撰稿记者丁牧群等人，并提民事求偿500万元台币。刑事部分丁等人被认定没有诽谤故意获不起诉，但在民事部分，台湾当地法院昨认为丁未善尽合理查证，判《苹果》和丁须连带赔偿吴宗宪40万元台币确定。
吴宗宪不满《苹果》在2003年10月2日，引述吴宗宪歌迷Linda的指控，报导“吴宗宪对女歌迷用过就丢”新闻，引发吴控告Linda涉嫌诽谤。2004年8月6日《苹果》再度报导吴宗宪控告歌迷Linda案开庭状况，内容中提及Linda律师当庭播放女方家人与吴宗宪电话录音，吴曾坦承与Linda发生关系。吴宗宪认为当天庭讯并未播放该捲录音带，愤而控告《苹果》及撰稿记者，法官审理后认为，该报导没有时效急迫性，记者开庭前得知律师有意声请勘验录音带内容，庭讯结束后却未进一步确认有无勘验，未善尽查证义务，因此判决《苹果》败诉。《苹果》法务经理叶锡波昨表示：“事实上的确有那卷录音带，后来检察官也曾当庭勘验过录音带内容，由此可知记者的确有合理查证。”丁牧群昨回应说：“我当天已分别向吴宗宪、Linda查证，但吴宗宪却拒绝回应，我已尽到合理查证义务。”据说，吴宗宪控告女歌迷Linda诽谤案，2004年8月5日两人在士林地检署当庭对质，吴宗宪仍然否认和Linda发生性关系，而且，同时吴宗宪还要老婆张葳葳控告Linda妨害家庭。检方开庭时，两人还当庭对质，一开始吴宗宪否认两人曾经发生过性关系，还要Linda指出他身体的特征，但Linda说：“那天在房间灯光昏暗，我没有看清楚他的身体。”为了证明两人有发生性关系，Linda当庭播放两人当年2月时情话绵绵的电话录音带，此时吴宗宪再也无法否认两人的关系，而吴宗宪此时表示：“我承认发生了性关系，但Linda也必须面对张葳葳”。接着整件事情发生了大转折，吴宗宪竟然要太太张葳葳对Linda提出告诉，控告她妨害家庭。在庭讯结束后，Linda痛批吴宗宪敢做不敢当!并且说已经对吴宗宪心死，但自己却不后悔，因为那是一段美好的过去。
